こんにちは。
応用情報や情報セキュリティの勉強はしていないですが、誰も回答されていないので・・・
応用情報は、基本情報と範囲は似ているので、分野で除外するのは難しそうです。
当然ながら応用情報のほうが詳しい内容なので、分野が同じでも知らない用語が多そうです。
そこも覚えておいたら強みになる可能性はありますが、余分な勉強が多くなるかも、という印象。
情報セキュリティも、除外できる分野はなさそうです。
セキュリティがメインなので、セキュリティ関連では基本情報で見たことのない用語も多少ありますが、応用情報と違ってそこまで難しくなさそうです。
情報セキュリティの科目Aは参考になる問題が多いかもしれません。
応用情報も見ておきたいなら、基本情報の科目A免除問題を解くのはどうですか？
免除問題は、ほとんどが基本情報と応用情報の過去問題から作られているみたいなので。
IPAのホームページで、”科目A免除”とかで検索すると出てきますよ。